【问题探讨】相同的程序换了不同型号的FPGA之后运行不正确了

开发了一个程序，之前在Cyclone中运行调试正常稳定，后来因项目需求将其换成了Cyclone IV，重新建立一个工程，讲就程序的所有.v文件加入到工程中，设置芯片的型号、电平，之后上电运行，在新板子中运行错误。
请问各位高手觉得是什么问题导致的呢？